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公司变更注册资金的网上操作时间因多种因素而异，无法给出确切的时间。

如果提交的资料准确并且符合相关规定，流程走下来大概需要一到三个工作日的时间，这仅仅是提交和审核的过程，整个流程还需要考虑其他因素，如提交资料是否齐全、企业类型等，如果涉及国有企业或外资企业等复杂类型的企业，时间可能会更长，不同地区办理的时间可能也有所不同，建议联系当地的工商部门或相关机构，获取更准确的时间信息。

答案仅供参考，具体时间和流程请以当地的实际要求为准。